dovetailgenomics 21006說明書

Dovetail™ Micro-C Kit在鄰近連接之前使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 進行染色質消化。該試劑盒提供了在生成 NGS 文庫之前對哺乳動物樣本進行鄰近連接步驟所需的所有試劑。該試劑盒與用于 Illumina 的 Dovetail™ 文庫模塊（貨號 #25004）和用于 Illumina 測序的第 3 方標準雙端文庫制備試劑盒兼容。

Dovetail Micro-C 套件具有以下主要優(yōu)點：

• 與序列無關的染色質片段化甚至可以在全基因組范圍內檢測染色質接觸（使用基于限制性酶的 Hi-C 方法無法覆蓋多達 20% 的基因組）

• 染色質接觸的超高核小體水平分辨率

• 最高的信噪比數(shù)據(jù)，同時豐富了遠程信息讀取和核小體保護片段

Dovetail Micro-C 庫豐富了所需的 Hi-C 特性

所述MNase酶既具有不依賴序列的內切核酸酶和外切核酸酶活所以產(chǎn)生的片段是核小體的長度（146堿基對）。該協(xié)議的鄰近結扎部分經(jīng)過優(yōu)化，以最大限度地提高遠程交互。由此產(chǎn)生的高度均勻的短片段能夠實現(xiàn)染色質接觸的核小體水平分辨率，這是理論分辨率的最大值。

改進的拓撲特征調用

在鄰近連接數(shù)據(jù)中檢測更高階特征（例如染色質環(huán)）的能力取決于豐富遠程信息讀取以捕獲染色質相互作用頻率。與基于 RE 的方法相比，增加的染色體構象信息讀取結合超高分辨率改善了循環(huán)調用。

Dovetail Micro-C *地捕捉核小體定位

用MNase消化的染色質顯示了在 Dovetail™ Micro-C 文庫中可見的全基因組核小體圖譜。該圖由與受核小體保護的 DNA 相關的序列讀取峰和代表可被MNase消化的干預 DNA 的谷組成。這種振蕩發(fā)生在 ~146 bp 的頻率（包裹在單核小體周圍的 DNA 長度）。此功能是 Micro-C 數(shù)據(jù)的，因為它在基于 RE 的方法中不存在。Dovetail™ Micro-C 實現(xiàn)的全基因組核小體定位和超分辨率染色體拓撲結構相結合，有助于從核小體到核小體染色質接觸的映射。